MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 93905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479588
2	NC_018658	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
3	NC_018658	TAA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479588
4	NC_018658	GCGGA	2	10	232	241	20 %	0 %	60 %	20 %	407479588
5	NC_018658	TGC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
6	NC_018658	CCCGGC	2	12	392	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479588
7	NC_018658	AC	3	6	437	442	50 %	0 %	0 %	50 %	407479588
8	NC_018658	GC	4	8	480	487	0 %	0 %	50 %	50 %	407479588
9	NC_018658	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479588
10	NC_018658	GTT	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479588
11	NC_018658	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479588
12	NC_018658	CTG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
13	NC_018658	GC	3	6	603	608	0 %	0 %	50 %	50 %	407479588
14	NC_018658	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479588
15	NC_018658	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479588
16	NC_018658	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
17	NC_018658	CGA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
18	NC_018658	T	6	6	747	752	0 %	100 %	0 %	0 %	407479588
19	NC_018658	TAA	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479588
20	NC_018658	CTG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
21	NC_018658	GACT	2	8	898	905	25 %	25 %	25 %	25 %	407479588
22	NC_018658	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479588
23	NC_018658	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
24	NC_018658	ACGT	2	8	1027	1034	25 %	25 %	25 %	25 %	407479588
25	NC_018658	GCCAAC	2	12	1065	1076	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407479588
26	NC_018658	CGTG	2	8	1106	1113	0 %	25 %	50 %	25 %	407479588
27	NC_018658	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479588
28	NC_018658	TAC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479588
29	NC_018658	GATGGC	2	12	1256	1267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407479588
30	NC_018658	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479588
31	NC_018658	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
32	NC_018658	TGCC	2	8	1349	1356	0 %	25 %	25 %	50 %	407479588
33	NC_018658	AG	3	6	1379	1384	50 %	0 %	50 %	0 %	407479588
34	NC_018658	AGA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479588
35	NC_018658	TTA	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479589
36	NC_018658	ACA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479589
37	NC_018658	GGT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
38	NC_018658	CTG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479589
39	NC_018658	TGG	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
40	NC_018658	CGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479589
41	NC_018658	GC	3	6	1654	1659	0 %	0 %	50 %	50 %	407479589
42	NC_018658	GCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479589
43	NC_018658	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
44	NC_018658	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479589
45	NC_018658	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479589
46	NC_018658	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
47	NC_018658	CCG	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479589
48	NC_018658	GAA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
49	NC_018658	GCTG	2	8	2212	2219	0 %	25 %	50 %	25 %	407479589
50	NC_018658	TC	3	6	2256	2261	0 %	50 %	0 %	50 %	407479589
51	NC_018658	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479589
52	NC_018658	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
53	NC_018658	ATG	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479589
54	NC_018658	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479589
55	NC_018658	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479590
56	NC_018658	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407479590
57	NC_018658	TTTAC	2	10	2904	2913	20 %	60 %	0 %	20 %	407479590
58	NC_018658	CGG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479590
59	NC_018658	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479590
60	NC_018658	AGC	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479590
61	NC_018658	GCG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479590
62	NC_018658	GC	3	6	3113	3118	0 %	0 %	50 %	50 %	407479590
63	NC_018658	GCGG	2	8	3418	3425	0 %	0 %	75 %	25 %	407479590
64	NC_018658	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479590
65	NC_018658	TGA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479590
66	NC_018658	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479590
67	NC_018658	CTC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407479591
68	NC_018658	GTAT	2	8	3713	3720	25 %	50 %	25 %	0 %	407479591
69	NC_018658	CAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
70	NC_018658	GGT	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
71	NC_018658	CGA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
72	NC_018658	CTCTGT	2	12	3843	3854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407479591
73	NC_018658	CGG	3	9	3908	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
74	NC_018658	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
75	NC_018658	GTA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479591
76	NC_018658	A	6	6	4124	4129	100 %	0 %	0 %	0 %	407479591
77	NC_018658	AGA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
78	NC_018658	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
79	NC_018658	CGTT	2	8	4313	4320	0 %	50 %	25 %	25 %	407479591
80	NC_018658	GAACAA	2	12	4329	4340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407479591
81	NC_018658	TCT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
82	NC_018658	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479591
83	NC_018658	CGG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
84	NC_018658	GCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
85	NC_018658	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
86	NC_018658	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	407479591
87	NC_018658	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407479591
88	NC_018658	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
89	NC_018658	CAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
90	NC_018658	GAAC	2	8	4701	4708	50 %	0 %	25 %	25 %	407479591
91	NC_018658	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
92	NC_018658	TGC	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
93	NC_018658	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
94	NC_018658	CG	4	8	4801	4808	0 %	0 %	50 %	50 %	407479591
95	NC_018658	CCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479591
96	NC_018658	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
97	NC_018658	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
98	NC_018658	GC	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	407479591
99	NC_018658	CT	3	6	5026	5031	0 %	50 %	0 %	50 %	407479591
100	NC_018658	CAT	4	12	5118	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479591
101	NC_018658	GCT	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
102	NC_018658	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
103	NC_018658	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479591
104	NC_018658	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
105	NC_018658	GAC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
106	NC_018658	TGGC	2	8	5366	5373	0 %	25 %	50 %	25 %	407479591
107	NC_018658	CGT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
108	NC_018658	TATC	2	8	5469	5476	25 %	50 %	0 %	25 %	407479591
109	NC_018658	CT	3	6	5500	5505	0 %	50 %	0 %	50 %	407479591
110	NC_018658	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
111	NC_018658	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
112	NC_018658	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
113	NC_018658	CGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
114	NC_018658	CTGG	2	8	5814	5821	0 %	25 %	50 %	25 %	407479591
115	NC_018658	TCG	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
116	NC_018658	TC	3	6	5841	5846	0 %	50 %	0 %	50 %	407479591
117	NC_018658	ACC	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
118	NC_018658	GTC	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
119	NC_018658	TGC	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
120	NC_018658	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479591
121	NC_018658	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
122	NC_018658	CGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
123	NC_018658	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
124	NC_018658	TTA	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479592
125	NC_018658	AT	3	6	6120	6125	50 %	50 %	0 %	0 %	407479592
126	NC_018658	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479592
127	NC_018658	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479592
128	NC_018658	ATC	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479592
129	NC_018658	ATC	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479592
130	NC_018658	TGA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479593
131	NC_018658	GAG	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407479593
132	NC_018658	GGC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479593
133	NC_018658	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479593
134	NC_018658	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479593
135	NC_018658	TC	3	6	6437	6442	0 %	50 %	0 %	50 %	407479593
136	NC_018658	CAAT	2	8	6467	6474	50 %	25 %	0 %	25 %	407479593
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141	NC_018658	CTG	2	6	6852	6857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479594
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151	NC_018658	TGA	3	9	7270	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479594
152	NC_018658	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479594
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160	NC_018658	TCT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479595
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255	NC_018658	GCGG	2	8	13939	13946	0 %	0 %	75 %	25 %	407479601
256	NC_018658	ATC	2	6	13993	13998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479601
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258	NC_018658	GCG	2	6	14132	14137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479601
259	NC_018658	CAG	2	6	14236	14241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479601
260	NC_018658	CCG	2	6	14243	14248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479601
261	NC_018658	AAT	2	6	14359	14364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479601
262	NC_018658	ACCAAT	2	12	14525	14536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407479602
263	NC_018658	CGT	2	6	14589	14594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479602
264	NC_018658	CGAGGT	2	12	14635	14646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407479602
265	NC_018658	TATC	2	8	14647	14654	25 %	50 %	0 %	25 %	407479602
266	NC_018658	GTG	2	6	14681	14686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479602
267	NC_018658	TGA	2	6	14740	14745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479602
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270	NC_018658	GCG	2	6	14856	14861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479602
271	NC_018658	TGC	2	6	14971	14976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479602
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275	NC_018658	AATC	2	8	15088	15095	50 %	25 %	0 %	25 %	407479602
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279	NC_018658	ACC	2	6	15257	15262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479602
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283	NC_018658	TGA	2	6	15400	15405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479602
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285	NC_018658	GCG	2	6	15567	15572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479602
286	NC_018658	TCT	2	6	15627	15632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479602
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288	NC_018658	TGGA	2	8	15656	15663	25 %	25 %	50 %	0 %	407479602
289	NC_018658	GGC	2	6	15665	15670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479602
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387	NC_018658	A	6	6	22065	22070	100 %	0 %	0 %	0 %	407479609
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499	NC_018658	TTA	2	6	27733	27738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479615
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